虽然政治保卫总局划归仲裁庭，但是马甲认为这种机构自己还是只负责行政领导为好，对具体的事务不宜插手太深。但是仲裁庭需要一个自己的调查部门，马甲吸取了日本的检察厅的概念，成立了仲裁庭调查部，马甲授予他有独立调查权。
而新成立的法律顾问办公室并非仅仅是混吃等死类的“研究所”，马甲赋予其的主要任务是立法――大量的立法。包括各种内部规章制度。穿越集团现在在这方面完全是空白，处理事情上是典型的“首长意志”的体现。
马甲认为这种状态急需改变。事实证明，一套好得制度胜过最英明的领导――更何况最英明的领导往往会不知不觉被巨大的权力和威望俘虏，沦为最恐怖的独裁者。穿越集团的小团体性质使得权力更容易被集中，出现独裁者的可能性愈来愈大。[搜索最新更新尽在]
必须在早期就把这种可能性扼杀在萌芽状态。所以在这次组织机构调整中，法学俱乐部出谋划策最多，大量的互相制约的手段都出自这个俱乐部。而领导们或者是真心拥护内部民主，或者是恐惧于在斗争中失败的可怕下场，纷纷支持法学俱乐部的改组措施。
除了引入了9执委制度加强集体领导之外，新体制大幅度的降低了原先的人民委员会的地位。过去有一些人民委员，如农业人民委员、民政人民委员在事实上都是执委。而另外一些人民委员却不是执委，这样容易给人造成混淆，不可避免的引起了许多内部的纷争。
现在人民委员被“一刀切”，统一不再是执委会的成员，级别上和过去的“部”一样了。只是在地位上象征性的略高于“部”一级。
机构调整也使得过去一些影响力特别大的委员会降低了，比如原先的农业委员会和民政委员会，现在都只是中央政务院下面的一个部门而已。不再有执委会的发言权。吴南海保留了他的农业人民委员的头衔，却被直接排挤出了执委会；邬德虽然高升到9执委之一，当上了企划院总裁这样一个关键性的岗位，却彻底的脱离了他最为熟悉的民政人民委员会。
至于穿越集团的暴力机构，不管是军队、警察、情报、特务机构在这次调整中地位全部下降。不仅陆、海军人民委员被完全排挤出了权力核心，军政军令分开体制进一步的降低了陆
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